Amazon専用ISBN

自分は某所で新刊情報サイトを運営しており、手動で各所から取得したISBNを元にマクロでAmazonリンクの作成を行っています。が、何故かリンク作成に失敗する書籍があり、よく見てみるとISBNが違っていました。それは以下の4作品で、他の書店サイトでは用いられていないISBNなのでAmazon専用のISBNとなっています。
落第騎士の英雄譚(キャバルリィ)5 (GA文庫) (isbn 9784797377927)
【Amazon.co.jp限定】異能バトルは日常系のなかで 7 書き下ろし4PリーフレットSS付き (GA文庫) (isbn 9784797377903)
【Amazon co.jp限定】FLESH&BLOOD(22)書き下ろしショートストーリー付き (キャラ文庫) (isbn 9784199007620)
【Amazon co.jp限定】不響和音 二重螺旋9 書き下ろしショートストーリー付き (キャラ文庫) (isbn 9784199007637)

ちなみに、3作品は発売日前後に通常のISBNでもAmazonに登録されました。
※2014/08/04現在、未登録 (isbn 9784797377545)
異能バトルは日常系のなかで 7 (GA文庫) (isbn 9784797377569)
FLESH&BLOOD〈22〉 (キャラ文庫) (isbn 9784199007569)
不響和音―二重螺旋〈9〉 (キャラ文庫) (isbn 9784199007576)

特徴としては、Amazon限定のショートストーリー付きといった点です。ただ、同月同レーベルの他の書籍でもAmazon限定のショートストーリー付きがあり、それらはISBNは新たに取得されていません。
何の違いがあるのか興味があったので、買ってみました。

GA文庫の場合は、シールを貼っているだけで全く同じようでした。キャラ文庫の場合は、本体もISBNが書き換えられていますが、それ以外は全く同じようでした。
どちらにしても、何のためにISBNを割り振ったのか理解不能です。意味があるのならその理由が知りたいところです。

追記（2014/08/07）
はてブなどより、Amazon専用ISBNは限定商品だからでは？との意見がありましたが、上記の書籍はAmazonの店舗特典であって通常版とも値段は変わらないので、限定商品とは呼べないと思っています。
AmazonでもAmazon以外の書店でも特典はつけている書籍は数多くあります。中でもGA文庫は特典をつけている書籍が多く、8月刊の場合は5点全てショートストーリー付きです。
なので、2点のみISBNを新たに取得しているのが不思議に思っています。